Čtyři měsíce před uplynutím termínu pro podání přihlášek jsou zveřejněny podmínky přijímacího řízení na internetových stránkách UK. Jde o jedinou oficiální autorizovanou verzi podmínek přijímacího řízení ke studiu na fakultách Univerzity Karlovy. V těchto podmínkách uchazeči naleznou, kromě informací o konání přijímacích zkoušek, o jejich obsahu či o výši poplatků, i konkrétní termíny konání Dnů otevřených dveří jednotlivých fakult.
Proces přijímacího řízení je zahájen doručením přihlášky ke studiu příslušné fakultě. Jednotlivé fakulty stanoví v podmínkách přijímacího řízení, které z forem přihlášky (listinná, elektronická, elektronická - platná až po doručení jejího podepsaného výtisku) lze na dané fakultě použít.
Lhůta pro podání přihlášek ke studiu bakalářských, navazujících magisterských a magisterských studijních programů pro akademický rok 2013/2014 skončila dne 28. února 2013; přihlášky do doktorských studijních programů lze podávat do 30. dubna 2013. Spolu s podáním přihlášky ke studiu je vyžadován doklad o zaplacení poplatku, spojeného s úkony v přijímacím řízení. Pokud se uchazeči hlásí ke studiu více programů, je třeba, aby podali samostatnou přihlášku na každý z nich a zaplatili odpovídající poplatky.
Uchazeč může z důvodu zdravotního handicapu – včetně specifických poruch učení – požádat o přizpůsobení přijímací zkoušky. V takovém případě musí být součástí přihlášky ke studiu písemná, zdůvodněná a lékařským potvrzením doložená žádost. O žádosti rozhoduje děkan. Je-li zdravotní handicap uplatněn dodatečně, například v rámci přezkumného řízení, nelze jej při rozhodování zohlednit.
Podklady pro ověřování splnění podmínek k přijetí (např. maturitní vysvědčení) lze předkládat do 30. září 2013. Pouze uchazeči, kteří vykonali maturitní zkoušku v podzimním zkušebním období, mohou předkládat podklady pro ověřování podmínek k přijetí až do 25. 10. 2013.
Každý uchazeč o studium obdrží po ověření podmínek pro přijetí rozhodnutí děkana fakulty o výsledku přijímacího řízení. Uchazeč má právo podat žádost o přezkoumání tohoto rozhodnutí prostřednictvím děkanátu, a to do třiceti dnů od doručení rozhodnutí.
Přijímací řízení do všech typů studia probíhá podle Řádu přijímacího řízení Univerzity Karlovy v Praze s tím, že podrobnosti mohou být upraveny v řádech přijímacího řízení jednotlivých fakult. Každoročně je Opatřením rektora stanoven Harmonogram přijímacího řízení pro akademický rok, který obsahuje termíny a lhůty týkající se přijímacího řízení, zejména termíny pro podávání přihlášek, termínové rozpětí, v němž lze konat přijímací zkoušky, a termíny pro doložení podkladů (maturitní vysvědčení, diplomy apod.).